واگن سازی تهران به عنوان یکی از شرکت های مهم و حساس در عرصه صنعت چند وقتی است درگیر برخی از حواشی و شایعات شده است، شایعاتی در‌خصوص تعدیل نیرو و حالا صدور احکام سریالی برای مدیران مختلف.